「世界的な野生動物GISデータベースの探索」
「世界中の野生動物GISデータベースを探検しよう」
Pythonを使用して国際自然保護連合(IUCN)の地理空間データベースを特徴付ける
国際自然保護連合(IUCN)は野生生物を保護するためのいくつかのプロジェクトを立ち上げました。そのうちの1つは、10万以上の種の生息地を含む高品質な世界的な地理空間データベースの作成です。この記事では、陸上哺乳類に焦点を当て、そのサブセットを探求します。
IUCNの絶滅のおそれのある野生生物の赤色リストデータベースには、15万以上の種が含まれており、そのうち80%以上に生息地の地理空間情報が与えられています。このデータベースの大きさだけでも、後の記事で取り上げるいくつかの課題が提起されます。今回は、より小さなサブセットに焦点を当てます。陸上哺乳類の世界データベースには、各種の生息地パッチに対応する12,436件のレコードがあります。この哺乳類・生息地データベースは約400の異なる情報源に基づいており、2008年から2022年までの間に登録された5,626種の二名法名が識別されています。さらに、このデータベースには種の目や科などの詳細な分類情報も含まれています。また、データベースの主な強みは、ポリゴンファイルの形で生息地の詳細な地理空間情報を持っていることです。この詳細については後ほど詳しく掘り下げます。
まず、このデータセットの非幾何学的な特徴を紹介し、その後、異なる種の地理空間分布に特化したいくつかの分析手法を実施します。この分析により、このデータソースを広め、野生生物保護政策における将来の取り組みに応用することを期待しています。
こちらでIUCNのデータソースを見つけることができます。私は陸上哺乳類のポリゴンデータをダウンロードしました(検索日時:2023年10月2日15:30:02)
この記事のすべての画像は筆者によって作成されました。
1. 統計的探索
1.1. データセットを解析する
まず、GeoPandasを使用してデータベースを解析し、その内容を確認しましょう:
import geopandas as gpd # バージョン: 0.9.0gdf_iucn = gpd.read_file('MAMMALS_TERRESTRIAL_ONLY')print('レコードの数:', len(gdf_iucn))…
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